頭部?jī)蓚?cè)各有類似貓耳的角，被稱為二觭人的女性變異人(新人類或超能力者)，因?yàn)榫哂袣缛祟惖牧α?，位于日本神奈川縣鐮倉(cāng)市外海的離島上的國(guó)立生態(tài)研究所，便機(jī)密地將這些女孩隔離起來(lái)并加以研究。某日，研究所內(nèi)發(fā)生重大的意外事故。原本被隔離的二觭人少女露西，因?yàn)榫l(wèi)的疏忽，得以突破拘束裝置，并殺害研究所內(nèi)的武裝警衛(wèi)，連研究所室長(zhǎng)藏間的秘書(shū)如月都慘遭殺害。雖然狙擊手以穿甲彈瞄準(zhǔn)她的頭部開(kāi)槍，卻僅擊破其鐵頭盔；露西雖然頭部受傷流血并墜入海中，仍得以幸存并成功逃亡。事件發(fā)生的次日，為了讀大學(xué)而前往鐮倉(cāng)找親戚幫忙的青年-耕太，和年幼玩伴的堂親-由香久別重逢。相偕出游至充滿回憶的海濱，碰上了因頭部受傷故造成另一個(gè)人格取而代之的露西；她只會(huì)發(fā)出Nyu的聲音，因此被取名為妮悠。妮悠對(duì)于自己是使人類滅亡的存在一無(wú)所知，耕太和由香兩人便決定帶到他們居住處的楓莊暫時(shí)定居下來(lái)。此時(shí)，研究所出動(dòng)了SAT（特殊突擊部隊(duì)）欲獵殺逃走的露西，SAT的隊(duì)員-坂東在海岸邊發(fā)現(xiàn)了人格轉(zhuǎn)換的妮悠。原本任務(wù)即將成功，卻因?yàn)槟萦苹謴?fù)了露西的人格，與坂東同行的隊(duì)員全數(shù)遭殺害，僅存戰(zhàn)敗后身受重傷（失去右臂與雙眼）的坂東一人。誓言對(duì)露西復(fù)仇的他，借由研究所的科學(xué)技術(shù)重新復(fù)活，后來(lái)逃出研究所、脫離SAT并回到鐮倉(cāng)，不擇手段地搜尋露西的下落??